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【纳昂达】NadPrep®️ 血浆游离 DNA 双端分子标签文库构建试剂盒(for MGI)-云医购

【纳昂达】NadPrep®️ 血浆游离 DNA 双端分子标签文库构建试剂盒(for MGI)

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品 牌
南京纳昂达(Nanodigmbio)
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不作为医疗器械管理
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NadPrep®️ 血浆游离 DNA 双端分子标签文库构建试剂盒(for MGI)是针对基于 DNBSEQ™ 技术的 MGI 高通量测序平台开发的双链 DNA 文库构建试剂盒。该试剂盒基于 A-T 连接原理,操作流程简单,适用于 1-500 ng 血浆游离DNA的全基因组测序 ,同时兼容液相杂交靶向捕获测序。 该试剂盒搭配双端分子标签(Bi-Molecular Identifier, BMI)接头,可满足血浆游离 DNA 低频突变分析的需求。

产品特色

  • 适用于血浆游离 DNA
  • 样本起始量低,文库转化率高
  • 双端分子标签接头助力低频突变分析
  • 包含 DNA 纯化磁珠,并适配优化的片段筛选方案
  • 单端接头(Single Index, SI)和双端唯一接头(MGI Unique Dual Index, MDI)可选

 

建库应用

应用方向

样本类型

推荐起始量

全基因组测序

血浆游离 DNA(无大片段污染)

≥ 1 ng(依据检测需求调整)

靶向捕获测序

血浆游离 DNA(无大片段污染)

≥ 1 ng(依据检测需求调整)

 

建库流程

产品表现

文库产出稳定高效

图1. NadPrep®️ 血浆游离 DNA 双端分子标签文库构建试剂盒(for MGI)对不同 DNA 起始量的文库产出。A. 搭配 NadPrep®️ BMI Adapter (MDI) Module 时 cfDNA 文库的产出稳定;B. 搭配 MDI 接头模块时的 cfDNA 文库片段分布示例(Agilent 2100 Bioanalyzer)。

 

分子标签助力低频突变分析

图2. 双端分子标签分析原理示意图。

来源于两个健康捐献者的 cfDNA 以 1% 比例混合,文库制备总投入量为 10 ng,人工模拟 1% 及 0.5% 突变。在 MGISEQ-2000 测序平台上,利用双端分子标签,在不同分析与过滤方法下进行低频突变分析的结果示例如下。

 

表1. 低频突变分析过滤方法

分析与过滤方法

详情

No BMI

根据片段在基因组上比对的起始、终止位点去除重复。

SSCS

利用单链分子标签进行一致性分析(Call Molecular Consensus Reads),形成单链一致性序列(Single Strand Consensus Sequence, SSCS)。

DCS211 / DCS633

利用双链分子标签,即互补链(Top / Bottom)分子标签进行一致性分析,形成双链一致性序列(Duplex Consensus Sequence, DCS),且 Top 与 Bottom Reads 均 ≥1(DCS211)/ 3(DCS633)。

DCS211 (≥ 2) / DCS633 (≥ 2)

DCS211 / DCS633 的基础上,支持该突变的DCS一致性序列 ≥ 2。

图3. 不同分析模式对于 1% 和 0.5% 模拟突变位点的 A. 灵敏度与 B. 阳性预测值。

图4. 不同分析模式对背景 “噪音” 的过滤情况。


本产品仅限研究使用,不用于临床诊断。

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